Dernière ligne de la résistance aux antibiotiques menacée – Actualités

Mise à jour des nouvelles – 22 décembre 2015

BBC News a rapporté que “des bactéries qui résistent à l’antibiotique le plus commun de dernier recours – colistin [voir ci-dessous] – ont été découvertes au Royaume-Uni”.

Des chercheurs de Santé publique en Angleterre ont trouvé des souches résistantes dans 15 des 24 000 échantillons bactériens enregistrés pour les cas de 2012 à 2015.

On signale également que des souches résistantes ont été trouvées dans trois élevages de porcs.

La menace pour la santé humaine est considérée comme faible. La situation est surveillée attentivement, au cas où cela changerait.

Article original posté le 19 novembre 2015

“La dernière ligne de défense antibiotique contre certaines infections graves est menacée”, rapporte The Guardian, après que des chercheurs ont découvert que les bactéries E. coli provenant de produits alimentaires en Chine ont développé une résistance à la colistine – un antibiotique polymixine.

Cet antibiotique est, en un sens, une arme de dernier recours dans l’arsenal des antibiotiques, et est parfois utilisé pour traiter des infections graves qui sont devenues résistantes à d’autres antibiotiques puissants.

Les chercheurs ont découvert que la résistance à la colistine était causée par un gène appelé MCR-1. Ce gène a été trouvé sur un morceau d’ADN bactérien qui peut être transféré entre les bactéries.

Ils ont prélevé un certain nombre d’échantillons prélevés sur des animaux dans des abattoirs et de la viande crue provenant de marchés ouverts et de supermarchés en Chine pour déterminer à quelle fréquence le gène MCR-1 se trouve dans les bactéries.

L’étude a révélé que le gène MCR-1 présent dans E. coli provenait de 15% des échantillons de viande crue et de 21% des animaux testés de 2011 à 2014. Le gène a également été trouvé chez E. coli chez 1% des patients hospitalisés en Chine.

Comme cette étude a été menée en Chine, nous ne savons pas si la situation est la même au Royaume-Uni. Cependant, la résistance aux antibiotiques est une préoccupation mondiale qui pourrait potentiellement progresser plus rapidement que de nouveaux antibiotiques peuvent être développés.

Un éditorial accompagnant l’étude recommande de restreindre l’utilisation de la polymixine dans l’agriculture, car nous pourrions nous retrouver dans une situation où les médecins seraient forcés de dire: «Désolé, je ne peux rien faire pour guérir votre infection».

D’où vient l’histoire?

L’étude a été réalisée par des chercheurs d’un certain nombre d’institutions, y compris l’Université agricole de Chine du Sud et l’Université agricole de Chine.

Il a été financé par le ministère chinois des sciences et de la technologie et la Fondation nationale chinoise des sciences naturelles.

L’étude a été publiée dans la revue médicale à comité de lecture The Lancet Infectious Diseases.

Cette recherche a été rapportée largement et avec précision par les médias britanniques, mais nous ne savons pas si les résultats et le niveau de risque s’appliquent à la population britannique.

De quel type de recherche s’aggissait-t-il?

Cette étude en laboratoire visait à étudier la cause de la résistance à l’un des groupes d’antibiotiques les plus puissants de «dernier recours».

Lors de la surveillance de routine des bactéries E. coli isolées du bétail en Chine, les chercheurs ont observé une augmentation de la résistance à l’antibiotique colistine.

Colistin est un antibiotique polymixine très fort. Il est administré directement dans la veine (par voie intraveineuse) pour traiter des infections graves – telles que les infections des poumons ou des voies urinaires – où d’autres antibiotiques fortement injectés ne sont pas efficaces, principalement parce que les bactéries ont développé une résistance.

La découverte que les bactéries semblent développer une résistance à la colistine est donc une préoccupation majeure. Les chercheurs ont voulu savoir comment les bactéries ont développé cette résistance.

Ce type d’étude est utile pour étudier comment la résistance aux antibiotiques s’est développée et comment elle peut être transférée entre les cellules bactériennes. Il donne également quelques indications sur la fréquence de ces bactéries résistantes en Chine. La question de savoir s’il y a eu une propagation plus large de la résistance doit être examinée plus avant.

Qu’est-ce que la recherche implique?

Cette étude visait à étudier la cause d’une augmentation importante de la résistance de E. coli à la classe des antibiotiques connus sous le nom de polymyxines chez les animaux d’élevage en Chine.

Les chercheurs ont sélectionné une souche de E. coli (SHP45) pour étude, car cette souche avait montré une résistance à la colistine / polymixine. Les chercheurs ont identifié que la cause de la résistance semblait être un gène appelé MCR-1, qui a été trouvé sur un fragment d’ADN appelé plasmide.

Les bactéries sont capables de transférer des plasmides à d’autres bactéries, ce qui pourrait aider à la propagation de la résistance aux antibiotiques. Les chercheurs ont donc étudié la possibilité que ces bactéries puissent transmettre la résistance à la colistine médiée par le plasmide. Des souches porcines de E. coli résistant à la colistine et un autre type de bactérie appelé K. pneumoniae ont été choisis pour cette étude.

Pour tester l’étendue de ce gène de résistance, des échantillons de bactéries appelées isolats cliniques ont été collectés chez des patients hospitalisés dans deux hôpitaux en Chine et ont été testés pour la présence du gène MCR-1.

D’autres échantillons ont été prélevés dans des abattoirs de porcs et de la viande crue provenant de 30 marchés ouverts et de 27 supermarchés situés dans sept régions de Guangzhou entre 2011 et 2014. Un isolat a été prélevé dans chaque animal et dans un échantillon de viande vendue au détail, puis a été analysé pour examiner la propagation du MCR-1 chez les animaux et les aliments.

Les souris ont été utilisées pour déterminer si les E. coli résistants à la colistine recueillis chez un patient hospitalisé seraient capables de résister à l’antibiotique chez les souris ayant reçu l’injection si on leur donnait l’équivalent de la dose de colistine humaine.

Quels ont été les résultats de base?

Les chercheurs ont découvert que la cause de la résistance à la colistine était le gène MCR-1. Le gène de résistance s’est révélé être transféré entre les cellules bactériennes par un processus appelé conjugaison, où les plasmides sont passés d’une bactérie à l’autre. Les chercheurs ont découvert que ce transfert pouvait se produire entre des espèces bactériennes, de E. coli à K. pneumoniae.

De 2011 à 2014, le gène MCR-1 a été trouvé dans des isolats de E. coli provenant de 78 (15%) des 523 échantillons de viande crue, 166 (21%) de 804 animaux et 16 (1%) patients hospitalisés avec une infection.

Comment les chercheurs ont-ils interprété les résultats?

Les chercheurs ont conclu que le gène MCR-1 est capable de provoquer une résistance à la colistine et est transféré entre les cellules bactériennes par le processus de conjugaison.

Bien qu’il soit actuellement confiné en Chine, le MCR-1 risque de se propager davantage secondaire. Davantage de surveillance et d’études épidémiologiques moléculaires sur la propagation de ce gène sont urgentes.

Conclusion

Cette étude chinoise fait suite à la surveillance de routine précédente, qui a révélé que certains animaux étaient porteurs de bactéries E. coli résistantes à l’un des groupes «d’antibiotiques de dernier recours» utilisés chez l’homme.

Ici, les chercheurs ont étudié comment cette résistance s’est développée et comment elle peut être transférée entre les cellules bactériennes. Ils ont trouvé qu’il est causé par le gène MCR-1, qui se trouve sur un fragment d’ADN qui peut être transféré entre les bactéries. Ce gène a été trouvé dans E. coli isolé à partir d’un certain nombre d’échantillons de viande et d’animaux crus pris par l’équipe de recherche.

La prévalence de MCR-1 trouvée dans les cellules d’E. Coli a été jugée assez élevée, ce qui est préoccupant et suggère qu’elle pourrait déjà être répandue parmi le bétail en Chine. Cependant, comme le reconnaissent les chercheurs, ils ont prélevé un nombre relativement restreint d’échantillons et mis en garde contre une extrapolation trop poussée des résultats.

Comme la Chine est le plus grand producteur mondial de produits avicoles et porcins, cette situation est très préoccupante pour leur population et leur économie. Les chercheurs suggèrent qu’une raison possible de cette résistance aux antibiotiques est l’utilisation de la colistine dans les aliments pour animaux en Chine.

On ne sait pas si la situation peut être similaire dans d’autres pays. La résistance aux antibiotiques est une préoccupation mondiale qui pourrait potentiellement progresser plus rapidement que de nouveaux antibiotiques plus forts peuvent être développés.

Sans antibiotiques efficaces, les infections que nous considérons comme des opérations non sérieuses et de routine pourraient comporter un risque beaucoup plus élevé de complications graves. D’autres études sont nécessaires pour étudier les moyens par lesquels les bactéries développent une résistance et comment nous pouvons nous attaquer à ce problème.

Il y a plusieurs choses que vous pouvez faire pour aider à prévenir le développement d’antibiotiques ou d’autres résistances aux antimicrobiens. Il s’agit notamment de reconnaître que de nombreuses infections respiratoires et gastro-intestinales courantes sont virales et n’ont pas besoin – et ne répondront pas – aux antibiotiques.

Si vous recevez un traitement antibiotique pour une maladie, il est très important de suivre le traitement prescrit, même si vous commencez à vous sentir mieux. Cela empêche les bactéries d’être exposées à une dose d’antibiotiques trop faible pour les éradiquer, mais leur donne un goût de l’antibiotique et leur permet de développer une résistance.